| 01. |
蕭文偉（2001）臺灣老樹保護之研究，臺灣大學植物病理研究所，碩士論文。320頁。 |
| 02. |
蕭文偉、傅春旭、姚瑞禎（2002）楓香之炭疽病，林業科學 17（1）：119-121。 |
| 03. |
B. Y. Hu, W. W. Hsiao and C. H. Fu (2002) First Report of Zonate Leaf Spot of Artocarpus altilis (Parkinson) Fosberg caused by Cristulariella moricola in Taiwan. Plant Dis. 86:1179. (SCI) (corresponding Author) |
| 04. |
C. H. FU.,W. W. Hsiao and J. C. YAO (2003) First report of Anthracnose on Taxus in Taiwan. Plant Dis. 87:873. (SCI) (corresponding Author) |
| 05. |
傅春旭、張東柱、孫銘源、胡寶元、蕭文偉（2003）以農用燻蒸劑-邁隆進行褐根腐病害區之土壤燻蒸。臺大實驗林研究報告17(3)：153-158。 |
| 06. |
王亞男、蕭文偉、林瑞進、沈介文、李金玲、黃淑玲（2004）長喙殼菌對六種針葉樹樹苗及杉木致病性之研究。台大實驗林研究報告18（1）：9-12。 |
| 07. |
莊鈴木、傅春旭、胡寶元、蕭文偉（2005）珍稀老樹病蟲害圖鑑，林務局出版，85頁。 |
| 08. |
W. W. Hsiao, C. H. Fu, and C. Y. Chen. (2006) First report of Formosan michelia seedlings root rot caused by Sclerotium rolfsii in Taiwan. Plant Dis. 90(5): 682(SCI). |
| 09. |
王亞男、孫岩章、蕭文偉、陳潔音、陳重銘（2006）過江藤之白絹病。國立臺灣生物資源暨農學院實驗林研究報告20（1）：45-50。 |
| 10. |
詹明勳、王亞男、高毓謙、陳勁豪、林金樹、蕭文偉（2006）樹木目視評估危險度及健康度-以台中縣市老樹為例。國立臺灣生物資源暨農學院實驗林研究報告 20（2）：99-116。 |
| 11. |
蕭文偉、王亞男、陳重銘、陳潔音、詹明勳（2006）鳳凰自然教育園區「茶科學與文化」教育研習之成果分析。國立臺灣生物資源暨農學院實驗林研究報告 20（2）：117-124。 |
| 12. |
Hsiao, Wen-Wei, Chuen-Hsu Fu, and Chieh-Yin Chen (2006) First report of Formosan michelia seedlings root rot caused by Sclerotium rolfsii in Taiwan. Plant Dis. 90(5): 682. (SCI) |
| 13. |
Chen, Chieh-Yin, Wen-Wei Hsiao, and En-Jung Sun (2007) First report of southern blight of Silvery messerschmidia seedlings in Taiwan. Plant disease 91(9): 1198. (SCI) |
| 14. |
Hsiao, Wen-Wei, Chuen-Hsu Fu, Chieh-Yin Chen, and En-Jung Sun (2007) First report of white root rot of Japanese Serissa caused by Rosellinia necatrix in Taiwan. Plant disease 91(11): 1512. (SCI) |
| 15. |
Hsiao, Wen-Wei, Yi-Sui Wu, Ya-Nan Wang, B. L. Huang and Li-Chun Huang (2008) First report of Rhizoctonia blight of coastal redwood tissue cultured derived sapling caused by Rhizoctonia solani AG-IV in Taiwan. Plant Disease 92(4): 655. (SCI) |
| 16. |
蕭文偉、朱珮綺、王亞男、陳潔音（2010）溪頭鳳凰山之大型真菌調查。臺大實驗林研究報告試驗簡報24（3）：209-215。 |
| 17. |
蕭文偉、朱珮綺、溫承哲、王亞男、陳潔音、孫岩章（2010）臺灣櫸褐根腐病之研究。臺大實驗林研究報告24（2）：79-84。 |
| 18. |
蕭文偉、張淑君、陳潔音、王亞男（2013）不同環境態度類型民眾的樹木保護認知研究。林業研究季刊35（1）：33-46。 |
| 19. |
蕭文偉、羅玉婷、陳岫女、劉瓊彬（2013）內洞國家森林遊樂區水環境化學。林業研究季刊35（2）：127-138。 |
| 20. |
Ting-Yu Lin, Chieh-Yin Chen, Shih-Chang Chien, Wen-Wei Hsiao, Fang-Hua Chu, Wen-Hsiung Li, Chin-Chung Lin, Jei-Fu Shaw, and Sheng-Yang Wang. 2011. Metabolite Profiles for Antrodia cinnamomea Fruiting Bodies Harvested at Different Culture Ages and from Different Wood Substrates. J. Agric. Food Chem. 59 (14): 7626–7635. (SCI) |
| 21. |
蕭文偉、張淑君、陳潔音*、王亞男（2013）不同環境態度類型民眾的樹木保護認知研究。林業研究季刊35（1）：33-46。 |
| 22. |
陳潔音、顏江河、蕭文偉、王介鼎、王亞男（2014）有益土壤微生物施用對臺灣肖楠及羅漢松苗木苗期病害及介質性質之研究。林業研究季刊36（3）：183-192。 |
| 23. |
陳潔音、王介鼎、王亞男、蕭文偉（2013）臺大實驗林和社樹木標本園大型真菌調查之分析。臺大實驗林研究報告27（1）：25-32。 |
| 24. |
林彥良、陳潔音、蕭文偉、曲芳華（2014）牛樟芝內切型纖維水解酵素之分子特性。臺大實驗林研究報告28（2）：131-138。 |
| 25. |
陳潔音、王亞男、蕭文偉（2014）臺大實驗林下坪自然教育園區大型真菌調查之分析。臺大實驗林研究報告28（3）：167-173。 |
| 26. |
陳潔音、顏江河、蕭文偉、王亞男、郭福麟（2015）臺大實驗林臺灣櫸造林地林分土壤呼吸量監測。臺大實驗林研究報告29（3）：161-171。 |
| 27. |
Chen, Chieh-Yin, Shih-Chang Chien, Nai-Wen Tsao, Chiem-Sing Lai, Ya-YunWang, Wen-Wei Hsiao, Fang-Hua Chu, Yueh-Hsiung Kuo, and Sheng-Yang Wang. 2016 Metabolite Profiling and Comparison of Bioactivity in Antrodia cinnamomea and Antrodia salmonea Fruiting Bodies. Planta Medica 82(3): 244-249. doi: 10.1055/s-0035-1558141. |
| 28. |
陳潔音、王亞男、蕭文偉（2017）臺大實驗林鳳凰自然教育園區大型真菌調查。臺大實驗林研究報告31（3）：173-180。 |
| 29. |
Kuang-Ming Shang, Tzu-Hsuan Su, Wai Leng Lee, Wen-Wei Hsiao, Ching-Yi Chioua, Bing-Ying Ho, Sheng-Yang Wang, Lie-Fen Shyur (2017) Novel effect and the mechanistic insights of fruiting body extract of medicinal fungus Antrodia cinnamomea against T47D breast cancer. Phytomedicine 24: 39-48. |
| 30. |
Wen-Wei Hsiao, En-Jang Sun*, Rey-Yuh Wu, Ting- Hsuan Hung. (2020) Malabar chestnut as a model and bioassay plant for Phellinus noxius brown root rot disease.Journal of plant medicine:62(2):17 – 23. |
| 31. |
徐源成、楊智凱、陳潔音、蕭文偉* (2021) 溪頭竹類標本園內之藻斑特性與種類調查。國立臺灣大學農學院實驗林研究報告 35(3):205-216。 |
| 32. |
陳勇至、王介鼎、陳潔音、徐源成、蕭文偉* (2021) 臺大實驗林紅檜生態保育區預定地大型真菌調查35(4):265-276。(通訊作者) |
| 33. |
Wen-Wei Hsiao, K. J. Senthil Kumar, Hui-Ju Lee, Nai-Wen Tsao, Sheng-Yang Wang *. Antimelanogenic Activity of Essential Oil from Calocedrus formosana and Its Composition Analysis. Plants 2022, 11(1), 62.(SCI) https://doi.org/10.3390/plants11010062 |
| 34. |
徐源成、陳潔音、楊智凱、蕭文偉* (2022) 下坪熱帶植物園內綠色頭孢藻 (Cephaleuros virescens) 寄主範圍與藻斑發生時期調查。國立中興大學農學院實驗林林業研究季刊44(1):1-20 。 |
